药学 · 计算研究 · 科研软件

连接治疗肽证据与计算发现。

博士研究期间主要围绕治疗肽开发机器学习方法与科研工具，将文献证据、可溯源数据和分子表征连接起来，结合计算方法研究与科研软件全栈开发。

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预计2027年6月博士毕业

01PepMinerva文献 → 证据 02PepDiana证据 → 结构化数据 03Bilingua-DPP-IV表征 → 预测

01 / 研究

三项相互衔接的研究

从文献中寻找证据，到组织治疗肽数据，再到构建预测工具。

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01 / 证据挖掘在审

PepMinerva

将治疗肽活性记录与来源证据关联的文献挖掘智能体。

文献挖掘 / LLM工作流↗

02 / 数据基础设施准备中

PepDiana

连接肽记录、活性观察与来源信息的治疗肽数据库。

数据溯源 / 数据库 / API↗

03 / 预测建模已接收

Bilingua-DPP-IV

用于DPP-IV抑制肽预测的双模态模型及配套科研Web服务。

ESM-C / Uni-Mol2↗

02 / 科研 + 工程

让研究成为可用的工具。

除模型开发外，我也构建用户界面、API与计算工作流，让研究成果能够被实际使用。具有三年实验室计算基础设施管理经验，累计部署和管理20余个科研网站与服务。

Python / PyTorchWeb / APILinux / Slurm

关于与简历 ↗

03 / 论文

代表性论文

完整论文列表 ↗

2026已接收

Bilingua-DPP-IV: A bimodal fusion convolutional neural network model for prediction of dipeptidyl peptidase IV inhibitory peptides

Zhixing Zhang, Qiule Yu, Chen Yang, Hao Duan, Jiaojiao Fang, Jiahao Xu, Changda Gong, Weihua Li, Guixia Liu, Yun Tang

ChemMedChem

2026年10月11日接收，尚未在线发表。

2026在审

PepMinerva: an evidence-grounded agent for extracting experimentally validated therapeutic peptide activities from full-text literature

Zhixing Zhang, Chen Yang, Qiule Yu, Hao Duan, Jiaojiao Fang, Jiahao Xu, Weihua Li, Guixia Liu, Yun Tang

Protein Science

2024已发表

MedChatZH: A tuning LLM for traditional Chinese medicine consultations

Yang Tan†, Zhixing Zhang†, Mingchen Li†, Fei Pan, Hao Duan, Zijie Huang, Hua Deng, Zhuohang Yu, Chen Yang, Guoyang Shen, Peng Qi, Chengyuan Yue, Yuxian Liu, Liang Hong, Huiqun Yu, Guisheng Fan, Yun Tang

Computers in Biology and Medicine · 2024;172:108290.

共同第一作者，署名第二

论文状态截至2026年10月17日。

04 / 联系我

欢迎交流研究。

我希望在分子、治疗肽或蛋白质计算设计领域开展研究，欢迎就研究、合作或工作机会与我联系。

2145573258@qq.com