プロフィール・CV

研究手法とツールを、ともに開発。

博士課程では主に治療用ペプチドを対象に、文献エビデンス、出典を追跡できるデータ、分子表現を活用した機械学習手法と研究ツールを開発しています。計算研究とフルスタックのソフトウェア開発を組み合わせて取り組んでいます。

Zhixing Zhang

学歴

2022.09–2027.06

薬学博士課程 · 2027年6月学位取得予定

華東理工大学

薬学院、修士・博士一貫課程。指導教員:Yun Tang教授。

薬学院の同一入学年度255人中、授業成績で1位。研究を含む総合評価ではありません。

2018.09–2022.06

製薬工学分野の学士課程修了

北京化工大学

製薬工学を専攻。

学部3年間の総合評価で80人中3位。授業成績、研究、課外活動などを含む評価。

研究・開発経歴

モデル開発に加え、研究成果を利用できるようにするインターフェース、API、計算ワークフローを構築しています。研究室の計算基盤を3年間管理し、20件以上の研究用ウェブサイト・サービスの導入と運用に携わってきました。

制御ノード1台と計算ノード12台を管理(うちGPUノード4台、GPU計11基)。運用を支援したadmetSAR 1.0–3.0の累積アクセス数は100万超、3.0は17万超(2026年10月時点)。プラットフォームの累積値であり、ユニークユーザー数や本人による集客実績ではない。

admetSAR 3.0 ↗

多様な分子を対象とした計算研究 ↗

手法・ツール

低分子、ペプチド、タンパク質の計算研究を、データ処理、フルスタック開発、それらを支える計算基盤の運用につなげています。

機械学習・科学プログラミング

データ整備、特徴量・事前学習表現の利用、予測モデルの開発・学習・評価・可視化。Bilinguaではペプチド配列と分子表現の融合を実装・評価。

手法・ツールPython · PyTorch · ESM-C · Uni-Mol2

タンパク質・抗体の計算設計

骨格生成・配列設計を構造予測と候補評価につなぐ。抗体研究ではCDR再設計、複数シードでのサンプリング、界面解析、モデリング条件の比較に取り組み、実験候補の優先順位付けを支援。

手法・ツールRFantibody / RFdiffusion · ProteinMPNN · AlphaFold2/3 · RoseTTAFold2

分子種を横断する計算モデリング

低分子の結合ポケット解析・探索、ペプチドの活性・物性予測、タンパク質・抗体の構造解析を経験。ドッキングと経験的親和性評価を使用し、Rosettaによるポケット設計やGlide・MM/GBSAを用いたチームの探索に参加。

手法・ツールPyMOL · Rosetta · Schrödinger · HADDOCK · PRODIGY · Glide / MM/GBSA

文献マイニング・研究エージェント

LLM APIとプロンプトを統合し、構造化抽出、出典への対応付け、多層的な評価を実装。PepMinervaでは検索から全文解析、振り分け、抽出・出力までを扱い、手作業の評価データ、CLI、Agent Skillを提供。

手法・ツールLLM APIs · Structured extraction · Benchmarking · CLI · Agent Skill

研究ソフトウェアのフルスタック開発

データ処理・モデル推論をバックエンド、API、操作画面につなげ、研究サイト・ウェブサーバー・デスクトップツールを開発・導入。PepDianaでは出典を保持したデータをウェブとプログラムから利用できるようにした。

手法・ツールData services · APIs · Web interfaces · Desktop applications

研究計算基盤

LinuxとCPU/GPUクラスタの管理を3年間担当。Slurmバッチ処理、ウェブサーバー設定、サービス保守を行い、20件以上の研究サイト・サービスと研究室向け利用ガイドを管理。

手法・ツールLinux · Slurm · CPU/GPU clusters · Nginx / Apache

主な受賞

  • 2025年 · 中国大学院生数学モデリングコンテスト 二等賞
  • 2024・2023年 · 中国大学院生数学モデリングコンテスト 三等賞
  • 2023・2022年 · 華東理工大学 大学院生一等学業奨学金
  • 2022年 · 北京市優秀卒業生
  • 2020年 · iGEM銀メダル(チーム受賞)
その他の表彰・活動を見る 9

学部・大学院時代の表彰を抜粋。チームでの受賞は明記しています。

  • 2023–2025年 · 華東理工大学 優秀学生リーダー・優秀社会活動賞
  • 2024年 · 華東理工大学 中国石油奨学金
  • 2021年 · 北京化工大学・化学工業出版社奨学金 銀賞
  • 2021年 · 北京化工大学 人民一等奨学金(2020–2021年度第2学期)
  • 2021年 · 「挑戦杯」自然科学部門 学内大会三等賞
  • 2020年 · 中国国際「インターネット+」大学生イノベーション・起業コンテスト 北京地区三等賞(抗結核薬プロジェクト、チーム受賞)
  • 2020年 · 北京化工大学 学部生イノベーションプロジェクト 修了評価「優秀」(抗結核薬、チーム成果)
  • 2019年 · 北京市大学生生物学知識コンテスト 二等賞
  • 2019年 · 北京化工大学 生命科学・技術学院「萌芽杯」学術論文コンテスト 総説部門一等賞

言語

中国語:母語。英語:中国の大学英語試験CET-6合格。

連絡先

研究についてのご連絡をお待ちしています。

分子、治療用ペプチド、タンパク質の計算設計に関する研究を希望しています。研究、共同研究、採用の機会について、お気軽にご連絡ください。

2145573258@qq.com ↗